Saskaņā ar Ministru kabineta noteikto kārtību zāļu ražotājam, uzsākot zāļu izplatīšanu Latvijā, Zāļu valsts aģentūrā jādeklarē ražotāja cena, par kādu zāļu ražotājs paredzējis konkrētās zāles izplatīt. Zāļu aptiekas cena veidojas, ražotāja realizācijas cenai pievienojot vairumtirdzniecības un mazumtirdzniecības uzcenojumu (atkarīgs no ražotāja cenas) un pievienotās vērtības nodokli. Maksimāli pieļaujamo uzcenojumu zālēm ir apstiprinājis Ministru kabinets, un ne zāļu vairumtirgotājs, ne aptieka nedrīkst piemērot augstāku uzcenojumu par noteikto. Tā kā zāļu lieltirgotavas un aptiekas drīkst piemērot uzcenojumu tikai noteiktajās robežās, zāļu cenu pieaugumu nosaka ražotāja realizācijas cenas.

Zāļu cenu veidošanas principus nosaka 25.10.2005. Ministru kabineta noteikumi Nr. 803 "Noteikumi par zāļu cenu veidošanas principiem". Šie noteikumi neattiecas uz kompensējamiem medikamentiem.